Bioanalyseur 2100 Agilent
Le Bioanalyseur permet de mesurer la taille et de quantifier les ARN, ADN et protéines. Il nécessite une petite quantité (1µL) d’échantillon et donne des résultats fiables et rapides. Il est essentiel pour vérifier la qualité des librairies avant séquençage.
MiSeq illumina : séquenceur moyen débit NGS
Le Miseq permet de générer 25 millions de séquences maximum. Les lectures peuvent aller jusqu’à 600 nucléotides en paired-end (2X300), soit un maximum de 15 Gigabases lues. Il peut répondre à des besoins variés comme la capture de séquences cibles (design à façon), du « small genome » et « small RNA », du reséquençage et du séquençage d’amplicons.
Prestations :
- Dosage (Qubit) et Vérification de la qualité des ADNs par Bioanalyseur
- Design des sondes pour les expériences de capture
- Préparation des librairies (capture de séquences cibles par le kit NimbleGen Roche)
- Passage sur Miseq et vérification de la qualité des runs logiciel FastQC
- Rendu des données (fichiers fastq) et sur demande fichiers vcf et bam.